Após a secagem, é feita a retirada das impurezas restantes no produto, sendo permitido um teor máximo de 0,5%.

Esta operação é chamada de limpeza propriamente dita, que permitirá melhor conservação do produto durante a armazenagem.
 

Pré-Limpeza

É a retirada de uma parte das impurezas do produto, facilitando seu transporte pelos elevadores. A secagem é realizada com mais facilidade e a remoção de materiais verdes e palhas evita fermentações na massa de grãos quando armazenados. Proporciona, também, aumento de rendimento das máquinas que vão realizar outras operações de beneficiamento, as quais exigem carga uniforme e regulagem eficiente.
 

Funcionamento dos Equipamentos

As máquinas de pré-limpeza e de limpeza operam segundo os mesmos princípios. O produto é separado de outros materiais pela ação de uma corrente de ar e por peneiras. Naquelas mais comuns e mais antigas, os grãos passam por uma série de peneiras planas com diferentes perfurações, onde são separados de outros materiais maiores e menores que ele.

Estes últimos têm sua separação melhorada pela ajuda de um ventilador (pré-limpeza) ou dois deles (limpeza). As peneiras também são diferentes para essas máquinas, mas todas fazem peneiramento oscilatório e trazem bolas de borracha sobre elas para manter as perfurações limpas. 

O ar usado nas máquinas de pré-limpeza e limpeza precisa ser conduzido para um ciclone, de forma que as impurezas transportadas sejam nele recolhidas e o ar possa ser devolvido ao ambiente com baixo nível de impurezas. 

Nota: o máximo rendimento de limpezas de uma M.P.L. (Máquina de Pré-Limpeza) é diretamente dependente do teor inicial não só de impureza como também da umidade de entrada da mercadoria, ou seja, quanto maior for o teor de umidade dos grãos, menor será a capacidade de operação da máquina. O mesmo acontece com os produtos que chegam com níveis mais elevados de avariados. 

Máquinas mais recentes no mercado fazem o peneiramento orbital, que resulta em baixos níveis de vibração. Além disso, os grãos são separados em ambientes fechados, pois elas também trabalham com circulação parcial (de 80% a 90% do ar usado).

Assim, conseguem reduzir os custos com ciclones e filtros de mangas existentes nos outros sistemas. Esse enclausuramento do ar torna a operação praticamente livre de pó, mantendo o ambiente de trabalho com bastante limpeza.